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成药性预测服务

  • 金斯瑞蓬勃生物基于强大且全面的生物信息学分析平台,为客户在早期抗体分子发现阶段提供成药性预测服务,降低您获得存在成药性风险分子的风险!

  • 成药性预测报告

    免疫原性

    +

    翻译后修饰分析

    +

    抗体聚集

免疫原性可导致 ADA 中和、超敏反应和细胞因子风暴,可抑制抗体药物的生物活性,减弱药效,甚至会在患者体内引起强烈的免疫反应并危及生命。在序列筛选阶段就对抗体的免疫原性进行预测,可以在进入CMC阶段前尽可能的避开免疫原性风险。目前计算机预测方法是抗体药早期发现阶段免疫原性评估的参考依据。

金斯瑞蓬勃生物对现有的蛋白数据库、表位数据库等进行了大批量的整合筛选,并基于原始数据库总结出最具代表性的大分子免疫原性的打分规则,提升了预测结果的可参考价值。不同于目前大部分公司仅基于表位肽和MHC-II的结合能力来预测免疫原性,金斯瑞蓬勃生物还在此基础上考虑了MHCII-抗原肽复合物被TCR识别的能力,同时增加了B细胞表位风险评估,更全面的预测了抗体药存在的免疫原性风险。

  • 翻译后修饰(post-translational modification,PTM)可引起抗体理化性质变化,降低抗体稳定性,改变与抗体Fc受体的相互反应,影响与目标抗原的结合活性,引起免疫原性。
  • 金斯瑞蓬勃生物可通过MOE软件分析,预测存在PTM风险的位点,指导PTM改造
  • 蛋白质聚集是抗体制造过程中的主要问题之一, 优化抗体内在特性将提高其溶解度、滴度、产量和安全性。
  • 正负电特性等特性预测聚集趋势。

部分成药性预测报告内容

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成药性优化服务

金斯瑞蓬勃生物基于成药性预测结果,通过进一步优化PTM位点,抗体疏水区域的序列,助力客户获得成药性能更佳的抗体分子。

・PTM优化服务

通过MOE软件分析常见PTM位点(如糖基化,氧化,脱酰胺,异构化等),根据PTM风险等级制定突变移除方案。

PTM位点分析
PTM位点移除
抗体验证
  • PTMs Motifs Risk evaluation PTM removal design
    free cystein C ++++ S
    Isomeriation DG/S ++++ EG/DA
    Deamidation NG +++ QG/NA
    Glycosylation N*T/S (except P) +++ Q*T/S N*A
    Oxidation M/W +++ No need to change

    图1:PTM优化服务流程与优化方案

里程碑 服务内容 交付 交付周期
1 抗体PTM移除序列设计
  • PTM移除设计方案
  • 0.2mg PTM移除后抗体
  • PTM移除后抗体序列
  • SEC-HPLC和亲和力检测报告
/
2 PTM 移除抗体生产以及亲和力检测 3-4周
3 PTM 移除抗体SEC-HPLC 分析(Top 3) 1 周

通过序列分析及结构软件分析抗体的PTM 位点,并进行PTM risk评估,根据评估的风险等级进行PTM removal的设计,并通过评估表达量,抗原结合力以及功能(ADCC和CDC活性检测)来进行lead选择。

CDR1 CDR2 CDR3
VH GFXXXXXXVY RASTRDS GGXXXXY
VH mutant1 GFXXXXXXVY RASTRES GGXXXXY
VH mutant2 GFXXXXXXVY RASTRDA GGXXXXY
  • 图1:亲和力检测

  • 如图1所示,与chimeric相比,S-A的突变体的表达量和抗原结合能力都显著降低,而D-E的突变体则更好的保留了原始抗体的特性。

  • 图2:ADCC检测

    IMAB362、嵌合体、VH+VL(D-E)和VH+VL(S-A)以剂量依赖的形式介导ADCC作用,变体(D-E)显示出与嵌合体相似的情况。

  • 图3:CDC检测

    IMAB362、嵌合体、VH+VL(D-E)和VH+VL(S-A)以剂量依赖的形式介导ADCC作用,变体(D-E)显示出与嵌合体相似的情况

・抗体聚焦优化服务

通过计算机模拟找到容易造成聚集的位点后,通过合理设计突变,使聚集倾向降低,同时通过引入人工聚集保守残基(artificial aggregation gatekeeper residues)来保持抗原结合。这种方法可以显着提高治疗性抗体的成药性,从而更有效的进入临床研究。

抗体序列分析与建模
抗体生产
抗体验证

通过序列分析及结构软件分析抗体的PTM 位点,并进行PTM risk评估,根据评估的风险等级进行PTM removal的设计,并通过评估表达量,抗原结合力以及功能(ADCC和CDC活性检测)来进行lead选择。

里程碑 服务内容 交付 交付周期
1 抗体序列分析与建模
  • 聚集分析报告
  • 0.2mg 聚集优化抗体
  • 聚集优化抗体序列
  • 亲和力检测报告
  • SEC-HPLC和亲和力检测报告
  • 保证至少一个序列的产量提升5倍
  • 保证无亲和力丢失
1周
2 聚集优化抗体生产以及亲和力检测 3-4周
3 聚集优化抗体SEC-HPLC 分析(Top 3) 1 周
4 早期成药性评估(可选)
  • 早期成药性分析报告
6-8周

通过MOE同源建模与hydrophobic patch分析确定改造方案,最终获得的突变体分子聚集特性显著改善从而得率获得提升,而亲和力未受影响。

NO. Clone Conc. (mg/mL) Volume Quantity(mg) Status Volume(ml) ka (1/Ms) kd (1/s) KD (M)
1 WT 0.048 1.40 0.07 Severe aggregation 50 5.55E+05 2.22E-04 4.00E-10
2 WT-M1 0.348 1.80 0.63 /(9) 50 6.87E+05 2.87E-04 4.18E-10
3 WT-M2 0.737 1.70 1.25 /(18) 50 1.14E+06 5.80E-04 5.07E-10
4 WT-M3 0.663 1.50 0.99 /(14) 50 1.01E+06 6.46E-04 6.39E-10

相关服务

金斯瑞蓬勃生物还可以利用强大的生物药分析平台,对优化后的抗体分子进行早期成药性评估,进一步降低生产失败的风险。